Characterization of Two <i>Campylobacter jejuni</i> Strains for Use in Volunteer Experimental-Infection Studies
Notice bibliographique
Résumé
The development of vaccines against Campylobacter jejuni would be facilitated by the ability to perform phase II challenge studies. However, molecular mimicry of the lipooligosaccharide (LOS) of most C. jejuni strains with human gangliosides presents safety concerns about the development of Guillain-Barré syndrome. Clinical isolates of C. jejuni that appeared to lack genes for the synthesis of ganglioside mimics were identified by DNA probe analyses. Two clinical isolates from Southeast Asia (strains BH-01-0142 and CG8421) were determined to express the LOS type containing N-acetyl quinovosamine. No ganglioside structures were observed to be present in the LOSs of these strains, and pyrosequence analyses of the genomes of both strains confirmed the absence of genes involved in ganglioside mimicry. The capsule polysaccharide (CPS) of BH-01-0142 was determined to be composed of galactose (Gal), 6-deoxy-ido-heptose, and, in smaller amounts, D-glycero-D-ido-heptose, and the CPS of CG8421 was observed to contain Gal, 6-deoxy-altro-heptose, N-acetyl-glucosamine, and minor amounts of 6-deoxy-3-O-Me-altro-heptose. Both CPSs were shown to carry O-methyl-phosphoramidate. The two genomes contained strain-specific zones, some of which could be traced to a plasmid origin, and both contained a large chromosomal insertion related to the CJEI3 element of C. jejuni RM1221. The genomes of both strains shared a high degree of similarity to each other and, with the exception of the capsule locus of CG8421, to the type strain of the HS3 serotype, TGH9011.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».