A natural variant of a host RNA-dependent RNA polymerase is associated with increased susceptibility to viruses by <i>Nicotiana benthamiana</i>
Notice bibliographique
Résumé
Nicotiana benthamiana often displays more intense symptoms after infection by RNA viruses than do other Nicotiana species. Here, we examined the role of RNA-dependent RNA polymerases (RdRPs) in N. benthamiana antiviral defense. cDNAs representing only two genes encoding RdRPs were identified in N. benthamiana. One RdRP was similar in sequence to SDE1/SGS2 required for maintenance of transgene silencing, whereas the second, named NbRdRP1m, was >90% identical in sequence to the salicylic acid (SA)-inducible RdRP from Nicotiana tabacum required for defense against viruses. NbRdRP1m expression was induced by SA treatment or challenge with Tobacco mosaic virus, but the gene and transcript sequences differed from those of other SA-inducible RdRPs in that they contained a 72-nt insert with tandem in-frame stop codons in the 5' portion of the ORF. N. benthamiana plants transformed with an SA-inducible RdRP gene from Medicago truncatula were more resistant to infection by Tobacco mosaic virus, Turnip vein-clearing virus, and Sunn hemp mosaic virus (members of Tobamovirus genus), but not to Cucumber mosaic virus and Potato virus X (members of different genera than the tobamoviruses). Our results indicate that N. benthamiana lacks an active SA- and virus-inducible RdRP and thus is hypersusceptible to viruses normally limited in their accumulation by this RdRP. These findings are significant for those studying virus-induced gene silencing, the hypersensitive response and systemic acquired resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».