Pex3p Initiates the Formation of a Preperoxisomal Compartment from a Subdomain of the Endoplasmic Reticulum in Saccharomyces cerevisiae
Notice bibliographique
Résumé
Peroxisomes are dynamic organelles that often proliferate in response to compounds that they metabolize. Peroxisomes can proliferate by two apparent mechanisms, division of preexisting peroxisomes and de novo synthesis of peroxisomes. Evidence for de novo peroxisome synthesis comes from studies of cells lacking the peroxisomal integral membrane peroxin Pex3p. These cells lack peroxisomes, but peroxisomes can assemble upon reintroduction of Pex3p. The source of these peroxisomes has been the subject of debate. Here, we show that the amino-terminal 46 amino acids of Pex3p of Saccharomyces cerevisiae target to a subdomain of the endoplasmic reticulum and initiate the formation of a preperoxisomal compartment for de novo peroxisome synthesis. In vivo video microscopy showed that this preperoxisomal compartment can import both peroxisomal matrix and membrane proteins leading to the formation of bona fide peroxisomes through the continued activity of full-length Pex3p. Peroxisome formation from the preperoxisomal compartment depends on the activity of the genes PEX14 and PEX19, which are required for the targeting of peroxisomal matrix and membrane proteins, respectively. Our findings support a direct role for the endoplasmic reticulum in de novo peroxisome formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».