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Solubilization, two-dimensional separation and detection of the cardiac myofilament protein troponin T

2002· article· en· W2018564191 sur OpenAlex
Ralf Labugger, Jason L. McDonough, Irina Neverova, Jennifer E. Van Eyk

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatographyChemistryHomogenization (climate)Isoelectric focusingSolubilizationMass spectrometryTroponin TTroponin IUreaWestern blotProteomicsBiochemistryBiologyEnzymeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteomics strongly relies on the separation of complex protein mixtures, with two-dimensional electrophoresis (2-DE) being a commonly used technique. However efficient separation requires adequate solubilization of the original sample which will determine whether all proteins are accurately represented. Cardiac muscle has presented a particular challenge to solubilization. Here we have optimized the solubilization, separation and detection of the myofilament protein troponin T (TnT). Human left ventricular tissue from a rejected donor transplant heart was homogenized under 19 different conditions and subjected to 2-DE and Western blot analysis for TnT. The optimal conditions for isoelectric focusing of intact TnT requires homogenization in 6 M urea, 2.5 M thiourea, 4% 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylamino]-1-propanesulfonate, with the addition of NaCl (2.5 M final concentration). TnT degradation products present in this severely damaged heart however, were differentially extracted from both each other and the intact molecule under the various conditions used. Despite adequate focusing of TnT it was found that a nonglutaraldehyde silver staining protocol, that is compatible with subsequent mass spectrometry, has greatly reduced sensitivity for TnT compared to Coomassie blue. Thus, care is required to avoid misrepresentation of troponin T in proteomic analysis in cardiac tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle