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Enregistrement W2018582209 · doi:10.1111/eva.12257

Genotyping‐by‐sequencing approach indicates geographic distance as the main factor affecting genetic structure and gene flow in Brazilian populations of <i>Grapholita molesta</i> (Lepidoptera, Tortricidae)

2015· article· en· W2018582209 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect Pheromone Research and Control
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésBiologyGene flowGenetic structureGenotypingTortricidaePopulationPEST analysisIsolation by distancePopulation geneticsEvolutionary biologyLepidoptera genitaliaEcologyGeneticsGenetic variationGenotypeBotanyGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The oriental fruit moth Grapholita molesta is one of the major pests of stone and pome fruit species in Brazil. Here, we applied 1226 SNPs obtained by genotyping-by-sequencing to test whether host species associations or other factors such as geographic distance structured populations of this pest. Populations from the main areas of occurrence of G. molesta were sampled principally from peach and apple orchards. Three main clusters were recovered by neighbor-joining analysis, all defined by geographic proximity between sampling localities. Overall genetic structure inferred by a nonhierarchical amova resulted in a significant ΦST value = 0.19109. Here, we demonstrate for the first time that SNPs gathered by genotyping-by-sequencing can be used to infer genetic structure of a pest insect in Brazil; moreover, our results indicate that those markers are very informative even over a restricted geographic scale. We also demonstrate that host plant association has little effect on genetic structure among Brazilian populations of G. molesta; on the other hand, reduced gene flow promoted by geographic isolation has a stronger impact on population differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,534
Score d'incertitude au seuil0,279

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle