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Enregistrement W2018608405 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-3575

Abstract 3575: Integration of estradiol signaling at the translational and transcriptional level in prostate cancer cells.

2013· article· en· W2018608405 sur OpenAlexaff
Luc Furic, Ola Larsson, Ivan Topisirović, Mark Frydenberg, John Pedersen, Gail P. Risbridger

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCell biologySignal transductionTranscription factorTranscriptional regulationEstrogen receptorPost-transcriptional regulationRegulation of gene expressionMessenger RNAPI3K/AKT/mTOR pathwayGene expressionCancer researchCancerGeneGeneticsBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction The prostate is an organ where the dual actions of estrogen receptors (ERα and ERβ)are just beginning to be understood and appreciated in a physiological context. Steroid receptors can act outside of the nucleus by interacting with cytoplasmic or membrane bound proteins and activating or inhibiting signaling pathways in a ligand dependent or independent manner. However, our understanding of this non-nuclear activity remains partial. Here, we attempt to uncover how estrogens regulate post-transcriptional gene expression programs in prostate cancer. The rationale for studying impacts on post-transcriptional gene expression programs downstream of a transcription factor is that there is often no direct correlation between the level of an mRNA and the corresponding protein product. Additionally, several intracellular signaling pathways affected by estrogen signaling (e.g MAPK and PI3K pathways) directly regulate gene expression post-transcriptionally. One post-transcriptional mechanism that is tightly regulated by various intracellular signaling pathways is mRNA translation initiation - a highly controlled step that is regulated on multiple levels and is commonly deregulated in cancer. Many factors acting on mRNAs in cis and/or in trans, including RNA-binding proteins, RNA secondary structures or modifications of the cap structure by methylation can have strong impact on the efficiency of mRNA translation. Thus, estrogen signaling, by directly and indirectly affecting intracellular signaling can potentially regulate translational activity of its transcriptional targets. Approach We used prostate derived cell lines to assess how estrogens regulate proliferation and survival as a function of their ability to modulate transcription and translation. We performed polysome-microarray approach where the cytoplasmic mRNA population is separated based on the number of associated ribosomes followed by quantification of mRNA levels in pools of actively translating mRNAs. Using prostate cell lines, epithelial and stromal in origin, we first characterized the level of transcription and translation in unstimulated conditions to obtain a snapshot of the translational activity of each mRNA in baseline conditions. Secondly, we tested the impact on transcription and translation following stimulation for 2 hours with estradiol or with an ERβ-specific agonist (8β-VE2). We are currently validating ERα/β translational targets and identifying regulatory RNA sequences that enable ER-induced translational control. Conclusion We endeavor to determine how the gene expression programs regulated by ERα and ERβ are integrated at the transcriptional and translational level to direct proliferation, growth and survival in prostate tumors. Citation Format: Luc Furic, Ola Larsson, Ivan Topisirovic, Mark Frydenberg, John Pedersen, Gail Risbridger. Integration of estradiol signaling at the translational and transcriptional level in prostate cancer cells. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 3575. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-3575

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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