Nuclear restriction fragment length polymorphism analysis of genetic diversity in western redcedar
Notice bibliographique
Résumé
Variation at 41 putative genetic loci, uncovered by 29 single or low-copy nuclear probes of restriction fragment length polymorphism, was examined in western redcedar (Thuja plicata Donn. ex D. Don). Only 8 of the 29 probes produced polymorphisms when HindIII-digested DNA samples from 18 trees from each of five geographic regions (90 trees in total) covering the entire geographic range of the species were analysed. The eight polymorphic probes were used against an additional sample of 160 trees (for a total of 250 trees or 50 per region) to permit higher resolving power of differentiation between the regions. Species-level expected heterozygosity (or total gene diversity, HT) was estimated at 0.070, a low value that is quite similar to that at isozyme loci. Nei's genetic distances between the regions were quite small and DST, the average gene diversity between populations, was only 0.0042, indicating a low degree of differentiation among geographic regions. No private alleles were found, and low-frequency alleles were widespread across the species range. These results suggest that the present range of western redcedar is occupied by descendants of a small number of lineages from a single refugial population that survived the drastic changes in climatic conditions associated with the last ice age.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».