Reaction of Canine Plasminogen with 6-Aminohexanoate: A Thermodynamic Study Combining Fluorescence, Circular Dichroism, and Isothermal Titration Calorimetry
Notice bibliographique
Résumé
The thermodynamics of the binding of 6-aminohexanoate (6-AH) to dog glu-plasminogen has been studied. Fluorescence titrations revealed four binding sites. Three yielded positive fluorescence changes on ligand binding; one yielded a negative fluorescence change. The fluorescence data gave no indication of cooperative interactions. Binding was studied using circular dichroism (CD). Near 295 nm there were small changes associated with binding ligand. These were magnified at 235 nm, a wavelength that is mainly associated with tryptophan bands. The dissociation constants obtained from the fluorescence were applied to the CD data and fit quite well. Below 220 nm, there were no significant differences between samples with or without 6-AH and, therefore, no substantial change in the secondary structure of the protein. Isothermal titration calorimetry was used in combination with the binding constants from fluorescence to study the enthalpy and entropy contributions to 6-AH binding. The enthalpies of association for the four sites are all negative. Their absolute values are small for the tight sites and large for the weakest. -TDeltaS is negative for the tight sites and positive for the weakest. The binding of 6-AH to plasminogen is entropically driven for the two tightest sites and enthalpically driven for the weakest site. The binding of 6-AH to lys-plasminogen has been studied and differs slightly from binding to glu-plasminogen. Most importantly, the binding of 6-AH for the weak site goes from enthalpy- to entropy-driven as is found with the other sites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».