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Enregistrement W2018725599 · doi:10.1021/bi001857b

Reaction of Canine Plasminogen with 6-Aminohexanoate:  A Thermodynamic Study Combining Fluorescence, Circular Dichroism, and Isothermal Titration Calorimetry

2001· article· en· W2018725599 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Interaction Studies and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsothermal titration calorimetryCircular dichroismTitrationCalorimetryFluorescenceChemistryIsothermal processAnalytical Chemistry (journal)Physical chemistryCrystallographyChromatographyThermodynamicsPhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The thermodynamics of the binding of 6-aminohexanoate (6-AH) to dog glu-plasminogen has been studied. Fluorescence titrations revealed four binding sites. Three yielded positive fluorescence changes on ligand binding; one yielded a negative fluorescence change. The fluorescence data gave no indication of cooperative interactions. Binding was studied using circular dichroism (CD). Near 295 nm there were small changes associated with binding ligand. These were magnified at 235 nm, a wavelength that is mainly associated with tryptophan bands. The dissociation constants obtained from the fluorescence were applied to the CD data and fit quite well. Below 220 nm, there were no significant differences between samples with or without 6-AH and, therefore, no substantial change in the secondary structure of the protein. Isothermal titration calorimetry was used in combination with the binding constants from fluorescence to study the enthalpy and entropy contributions to 6-AH binding. The enthalpies of association for the four sites are all negative. Their absolute values are small for the tight sites and large for the weakest. -TDeltaS is negative for the tight sites and positive for the weakest. The binding of 6-AH to plasminogen is entropically driven for the two tightest sites and enthalpically driven for the weakest site. The binding of 6-AH to lys-plasminogen has been studied and differs slightly from binding to glu-plasminogen. Most importantly, the binding of 6-AH for the weak site goes from enthalpy- to entropy-driven as is found with the other sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle