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Enregistrement W2018733281 · doi:10.1093/nar/gks041

CUX1 transcription factor is required for optimal ATM/ATR-mediated responses to DNA damage

2012· article· en· W2018733281 sur OpenAlexafffund
Charles Vadnais, Sayeh Davoudi, Mojdeh Afshin, Ryoko Harada, Rachel Dudley, Pier‐Luc Clermont, Elliot Drobetsky, Alain Nepveu

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDNA damageBiologyGene knockdownTranscription factorCell biologyAutophosphorylationGeneRAD51DNADNA repairMolecular biologyGeneticsPhosphorylationProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The p110 Cut homeobox 1 (CUX1) transcription factor regulates genes involved in DNA replication and chromosome segregation. Using a genome-wide-approach, we now demonstrate that CUX1 also modulates the constitutive expression of DNA damage response genes, including ones encoding ATM and ATR, as well as proteins involved in DNA damage-induced activation of, and signaling through, these kinases. Consistently, RNAi knockdown or genetic inactivation of CUX1 reduced ATM/ATR expression and negatively impacted hallmark protective responses mediated by ATM and ATR following exposure to ionizing radiation (IR) and UV, respectively. Specifically, abrogation of CUX1 strongly reduced ATM autophosphorylation after IR, in turn causing substantial decreases in (i) levels of phospho-Chk2 and p53, (ii) γ-H2AX and Rad51 DNA damage foci and (iii) the efficiency of DNA strand break repair. Similarly remarkable reductions in ATR-dependent responses, including phosphorylation of Chk1 and H2AX, were observed post-UV. Finally, multiple cell cycle checkpoints and clonogenic survival were compromised in CUX1 knockdown cells. Our results indicate that CUX1 regulates a transcriptional program that is necessary to mount an efficient response to mutagenic insult. Thus, CUX1 ensures not only the proper duplication and segregation of the genetic material, but also the preservation of its integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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