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Enregistrement W2018847224 · doi:10.1242/dev.077461

Functional interactions between Fat family cadherins in tissue morphogenesis and planar polarity

2012· article· en· W2018847224 sur OpenAlexafffund
Sakura Saburi, Ian Hester, Lisa V. Goodrich, Helen McNeill

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyMorphogenesisCadherinCell biologyConvergent extensionHomologous chromosomePolarity (international relations)GeneticsAnatomyGeneEmbryoEmbryogenesisCellGastrulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The atypical cadherin fat (ft) was originally discovered as a tumor suppressor in Drosophila and later shown to regulate a form of tissue patterning known as planar polarity. In mammals, four ft homologs have been identified (Fat1-4). Recently, we demonstrated that Fat4 plays a role in vertebrate planar polarity. Fat4 has the highest homology to ft, whereas other Fat family members are homologous to the second ft-like gene, ft2. Genetic studies in flies and mice imply significant functional differences between the two groups of Fat cadherins. Here, we demonstrate that Fat family proteins act both synergistically and antagonistically to influence multiple aspects of tissue morphogenesis. We find that Fat1 and Fat4 cooperate during mouse development to control renal tubular elongation, cochlear extension, cranial neural tube formation and patterning of outer hair cells in the cochlea. Similarly, Fat3 and Fat4 synergize to drive vertebral arch fusion at the dorsal midline during caudal vertebra morphogenesis. We provide evidence that these effects depend on conserved interactions with planar polarity signaling components. In flies, the transcriptional co-repressor Atrophin (Atro) physically interacts with Ft and acts as a component of Fat signaling for planar polarity. We find that the mammalian orthologs of atro, Atn1 and Atn2l, modulate Fat4 activity during vertebral arch fusion and renal tubular elongation, respectively. Moreover, Fat4 morphogenetic defects are enhanced by mutations in Vangl2, a 'core' planar cell polarity gene. These studies highlight the wide range and complexity of Fat activities and suggest that a Fat-Atrophin interaction is a conserved element of planar polarity signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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