The relationship of TP53 R72P polymorphism to disease outcome and TP53 mutation in myelodysplastic syndromes
Notice bibliographique
Résumé
Nonsynonymous TP53 exon 4 single-nucleotide polymorphism (SNP), R72P, is linked to cancer and mutagen susceptibility. R72P associations with specific cancer risk, particularly hematological malignancies, have been conflicting. Myelodysplastic syndrome (MDS) with chromosome 5q deletion is characterized by erythroid hypoplasia arising from lineage-specific p53 accumulation resulting from ribosomal insufficiency. We hypothesized that apoptotically diminished R72P C-allele may influence predisposition to del(5q) MDS. Bone marrow and blood DNA was sequenced from 705 MDS cases (333 del(5q), 372 non-del(5q)) and 157 controls. Genotype distribution did not significantly differ between del(5q) cases (12.6% CC, 38.1% CG, 49.2% GG), non-del(5q) cases (9.7% CC, 44.6% CG, 45.7% GG) and controls (7.6% CC, 37.6% CG, 54.8% GG) (P=0.13). Allele frequency did not differ between non-del(5q) and del(5q) cases (P=0.91) but trended towards increased C-allele frequency comparing non-del(5q) (P=0.08) and del(5q) (P=0.10) cases with controls. Median lenalidomide response duration increased proportionate to C-allele dosage in del(5q) patients (2.2 (CC), 1.3 (CG) and 0.89 years (GG)). Furthermore, C-allele homozygosity in del(5q) was associated with prolonged overall and progression-free survival and non-terminal interstitial deletions that excluded 5q34, whereas G-allele homozygozity was associated with inferior outcome and terminal deletions involving 5q34 (P=0.05). These findings comprise the largest MDS R72P SNP analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».