Biosynthesis of uronamide sugars in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> O6 and <i>Escherichia coli</i> O121 O antigens
Notice bibliographique
Résumé
The major component of the outer leaflet of the outer membrane of Gram-negative bacteria is lipopolysaccharide (LPS). The outermost domain of LPS is a polysaccharide called O antigen. Pseudomonas aeruginosa establishes biofilms on wet surfaces in a wide range of habitats and mutations in O-antigen biosynthesis genes affect bacterial adhesion and the structure of these biofilms. The P. aeruginosa O6 O antigen contains a 2-acetamido-2-deoxy-d-galacturonamide (d-GalNAcAN) residue. O-antigen biosynthesis in this serotype requires the wbpS gene, which encodes a protein with conserved domains of the glutamine-dependent amidotransferase family. Replacement of conserved amino acids in the N-terminal glutaminase conserved domain of WbpS inhibited O-antigen biosynthesis under restricted-ammonia conditions, but not in rich media; suggesting that this domain functions to provide ammonia for O-antigen biosynthesis under restricted-ammonia conditions, by hydrolysis of glutamine. Escherichia coli O121 also produces a d-GalNAcAN-containing O antigen, and possesses a homologue of wbpS called wbqG. An E. coli O121 wbqG mutant was cross-complemented by providing wbpS in trans, and vice versa, showing that these two genes are functionally interchangeable. The E. coli O121 wbqG mutant O antigen contains 2-acetamido-2-deoxy-d-galacturonate (d-GalNAcA), instead of d-GalNAcAN, demonstrating that wbqG is specifically required for biosynthesis of the carboxamide in this sugar.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».