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Enregistrement W2019162434 · doi:10.1139/b02-088

A 75-kDa plant protein isolated by tubulin-affinity chromatography is a peroxisomal matrix enzyme

2002· article· en· W2019162434 sur OpenAlexvenueno aff
John Harper, N. D. Weerakoon, John Gardiner, Leila M. Blackman, Jan Marc

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustralian National UniversityPennsylvania State UniversityArizona State UniversityPurdue University
Mots-clésPeroxisomeBiochemistryArabidopsisBiologyOrganelleMicrotubuleTubulinPeroxisomal targeting signalAffinity chromatographyPeptide sequenceEnzymeCell biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The function of microtubules in plant cells relies on their interactions with various, largely unidentified, proteins. A 75-kDa polypeptide (p75) was isolated previously by tubulin affinity chromatography of tobacco BY-2 proteins and is further characterized here. We have obtained two peptide sequences of 13 and 8 amino acid residues from the p75, which have 77% and 87% similarity to two putative dTDP-glucose 4,6-dehydratase proteins of 74.9 and 75.3 kDa in Arabidopsis. The proteins contain a peroxisomal matrix targeting signal SKL or AKL near their carboxyl terminus, an epimerase-dehydratase motif, and a region of 321 amino acid residues sharing 41% similarity with a dTDP-glucose 4,6-dehydratase from Aneurinibacillus thermoaerophilus. A monoclonal antibody 4B9 against the tobacco p75 reacted with a 75-kDa polypeptide on immunoblots of tobacco BY-2 and Arabidopsis protein extracts, and in immunofluorescence microscopy it revealed small organelle-like structures in tobacco BY-2 and Arabidopsis root-tip cells. Double labelling with an antibody against the peroxisomal marker enzyme, catalase, showed that the organelles are indeed peroxisomes. The peroxisomes were in closer association with actin filaments than microtubules. This observation supports recent findings that plant peroxisomes move on actin filaments. We propose that the peroxisomal dTDP-glucose 4,6-dehydratases may be involved in plant defence responses to oxidative stress.Key words: actin, antibodies, microtubules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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