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Enregistrement W2019181873 · doi:10.1073/pnas.0611669104

<i>GATA6</i> is an astrocytoma tumor suppressor gene identified by gene trapping of mouse glioma model

2007· article· en· W2019181873 sur OpenAlexafffund
Deepak Kamnasaran, Baoping Qian, Cynthia Hawkins, William L. Stanford, Abhijit Guha

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationToronto Western HospitalHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity of California, San FranciscoUniversity of Toronto
Mots-clésBiologyAstrocytomaGATA6Cancer researchCarcinogenesisTumor suppressor geneLoss of heterozygosityGene expressionGliomaGeneMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malignant astrocytomas are the most common and lethal adult primary brain tumor. Retroviral gene trapping of nontransformed neonatal astrocytes from a glial fibrillary acidic protein (GFAP):(V12)Ha-Ras murine astrocytoma model led to isolation of the transcription factor Gata6. Loss of Gata6 resulted in enhanced proliferation and transformation of astrocytes. Human malignant astrocytoma cell lines, explant xenografts, and operative specimens demonstrated loss of GATA6 expression. Loss-of-function GATA6 mutations with loss of heterozygosity of the GATA6 locus were found in human malignant astrocytoma specimens but not in lower-grade astrocytomas or normal adult astrocytes. Knockdown of Gata6 expression in (V12)Ha-Ras or p53-/- astrocytes, but not in parental murine or human astrocytes, led to acceleration of tumorgenesis. Knockin GATA6 expression in human malignant astrocytoma cells reduced their tumorgenic growth with decreased VEGF expression. Collectively, these data demonstrate that GATA6, isolated from a murine astrocytoma model, is a novel tumor suppressor gene that is a direct target of mutations during malignant progression of murine and human astrocytomas. This work also demonstrates the utility of random mutagenesis strategies, such as gene trapping, on murine cancer models toward discovery of novel genetic alterations in corresponding human cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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