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Enregistrement W2019388052 · doi:10.1371/journal.pone.0030425

The Translation Elongation Factor eEF-1Bβ1 Is Involved in Cell Wall Biosynthesis and Plant Development in Arabidopsis thaliana

2012· article· en· W2019388052 sur OpenAlexafffund
Zakir Hossain, Lisa Amyot, Brian D. McGarvey, Margaret Y. Gruber, Jinwook Jung, Abdelali Hannoufa

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensWestern UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Ontario Institute of Technology
Mots-clésMutantBiologyXylemCambiumCell biologyArabidopsisArabidopsis thalianaWild typeBiochemistryBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The eukaryotic translation elongation factor eEF-1Bβ1 (EF1Bβ) is a guanine nucleotide exchange factor that plays an important role in translation elongation. In this study, we show that the EF1Bβ protein is localized in the plasma membrane and cytoplasm, and that the transcripts should be expressed in most tissue types in seedlings. Sectioning of the inflorescence stem revealed that EF1Bβ predominantly localizes to the xylem vessels and in the interfascicular cambium. EF1Bβ gene silencing in efβ caused a dwarf phenotype with 38% and 20% reduction in total lignin and crystalline cellulose, respectively. This loss-of-function mutant also had a lower S/G lignin monomer ratio relative to wild type plants, but no changes were detected in a gain-of-function mutant transformed with the EF1Bβ gene. Histochemical analysis showed a reduced vascular apparatus, including smaller xylem vessels in the inflorescence stem of the loss-of-function mutant. Over-expression of EF1Bβ in an eli1 mutant background restored a WT phenotype and abolished ectopic lignin deposition as well as cell expansion defects in the mutant. Taken together, these data strongly suggest a role for EF1Bβ in plant development and cell wall formation in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,135 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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