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Enregistrement W2019429284 · doi:10.1366/11-06312

Raman Microscopy-Based Cytochemical Investigations of Potential Niche-Forming Inhomogeneities Present in Human Embryonic Stem Cell Colonies

2011· article· en· W2019429284 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueApplied Spectroscopy · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEmbryonic stem cellRaman spectroscopyMicroscopyStem cellNicheBiophysicsCell biologyChemistryNanotechnologyMaterials scienceBiologyOpticsBiochemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Measuring spatial and temporal patterns of cytochemical variation in human embryonic stem cell (hESC) colonies is necessary for understanding the role of cellular communication in spontaneous differentiation, the mechanisms of biological niche creation, and structure-generating developmental processes. Such insights will ultimately facilitate directed differentiation and therewith promote advances in tissue engineering and regenerative medicine. However, the patterns of cytochemical inhomogeneities of hESC colonies are not well studied and their causes are not fully understood. We used Raman spectroscopic mapping to contrast supracellular variations in cytochemical composition across pluripotent and partly differentiated hESC colonies to gain a better understanding of the early-stage (i.e., 5 days) effects of the differentiation process on the nature and evolution of these patterns. Higher protein-to-nucleic acid ratios, a differentiation status indicator observed previously using Raman spectroscopy, confirmed reported results that spontaneous differentiation is more pronounced on the edges of a colony than elsewhere. In addition, pluripotent and partly differentiated colonies also showed higher lipid concentrations relative to nucleic acids at colony edges in contrast to relative glycogen concentrations, which were up to 400% more pronounced in the colony centers compared to their edges. Pluripotent and partly differentiated colonies differed, with the latter having higher average protein-to-nucleic acid and lipid-to-nucleic acid ratios but a lower glycogen-to-nucleic acid ratio. In both cases, cell density, pluripotency, and high glycogen appeared to vary in tandem. Spatial variations in glycogen- and protein-to-nucleic acid ratios have features on the order of 100 μm and larger. These dimensions are consistent with those reported for stem cell niches and suggest that cytochemical inhomogeneities may provide colony-level information about niches and niche formation. These results demonstrate Raman mapping to be a potentially useful technique for revealing the complexities in the spatial organization of hESC cultures and thus for monitoring the evolution of engineered hESC niches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle