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Enregistrement W2019521269 · doi:10.1139/o02-115

Mammalian <i>EGLN</i> genes have distinct patterns of mRNA expression and regulation

2002· article· en· W2019521269 sur OpenAlexvenueno aff
Mark E. Lieb, Keon E. Menzies, Maria C. Moschella, Rujing Ni, Mark B. Taubman

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésC2C12MyogenesisBiologyGene isoformVascular smooth muscleMyocyteMessenger RNATranscription factorMolecular biologyCell biologyGene expressionSkeletal muscleHypoxia-inducible factorsRegulation of gene expressionGeneGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian EGLN family contains three paralagous genes (EGLN1, EGLN2, and EGLN3) encoding prolyl hydroxylase isoforms that mediate the oxygen-dependent targeting of the transcription factor hypoxia inducible factor alpha to the proteosome. The rat orthologue of EGLN3 (SM-20) exhibits tissue-restricted expression, is induced by growth factors in cultured vascular smooth muscle, and is up-regulated during myogenesis. To determine if all three EGLN genes are coordinately regulated, we examined their mRNA expression in murine tissues and in cultured cells. We now report that the three murine EGLN mRNAs have unique but overlapping patterns of tissue expression. The most striking differences were in the heart, where EGLN3 had its highest levels of expression, and the testis, where EGLN2 was the only isoform expressed. In cultured vascular smooth muscle cells, serum treatment led to up-regulation of EGLN1 and EGLN3, but not EGLN2, and only EGLN3 was superinduced by cyclohexamide. In cultured C2C12 myocytes, EGLN3 was up-regulated during differentiation, whereas EGLN1 and EGLN2 were constitutively expressed. The abundance of EGLN3 mRNA in the heart, its induction by growth factors in vascular smooth muscle, and its regulation during C2C12 differentiation suggest a unique role for EGLN3 and might justify the development of isoformspecific inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations184
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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