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Enregistrement W2019524306 · doi:10.1021/jf073505i

Effect of Transgenes on Global Gene Expression in Soybean Is within the Natural Range of Variation of Conventional Cultivars

2008· article· en· W2019524306 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetically Modified Organisms Research
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCultivarBiologyTransgeneGene expressionGeneTranscriptomeDNA microarrayGenotypeGene expression profilingGenetically modified cropsGene chip analysisGeneticsComputational biologyBiotechnologyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Current safety assessment for novel crops, including transgenic crops, uses a targeted approach, which relies on compositional analysis. The possibility that transgene expression could lead to unintended effects remains a debated issue. This study used transcriptome profiling as a nontargeted approach to evaluate overall molecular changes in transgenic soybean cultivars. Global gene expression was measured in the first trifoliate leaves of two transgenic and three conventional soybean cultivars using the soybean Affymetrix GeneChip. It was found that gene expression differs more between the two conventional cultivars than between the transgenics and their closest conventional cultivar investigated and that the magnitudes of differences measured in gene expression and genotype (determined by SSR analysis) do not necessarily correlate. A MySQL database coupled with a CGI Web interface was developed to store and present the results ( http://soyxpress.agrenv.mcgill.ca/). By integrating the microarray data with gene annotations and other soybean data, a comprehensive view of differences in gene expression is explored between cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle