Constitutive fusion of ubiquitin to PCNA provides DNA damage tolerance independent of translesion polymerase activities
Notice bibliographique
Résumé
In response to replication-blocking DNA lesions, proliferating cell nuclear antigen (PCNA) can be conjugated with a single ubiquitin (Ub) or Lys63-linked Ub chains at the Lys164 residue, leading to two modes of DNA damage tolerance (DDT), namely translesion synthesis (TLS) and error-free DDT, respectively. Several reports suggest a model whereby monoubiquitylated PCNA recruits TLS polymerases through an enhanced physical association. We sought to examine this model in Saccharomyces cerevisiae through artificial fusions of Ub to PCNA in vivo. We created N- and C- terminal gene fusions of Ub to PCNA-K164R (collectively called PCNA.Ub) and found that both conferred tolerance to DNA damage. The creation of viable PCNA.Ub strains lacking endogenous PCNA enabled a thorough analysis of roles for PCNA mono-Ub in DDT. As expected, the DNA damage resistance provided by PCNA.Ub is not dependent on RAD18 or UBC13. Surprisingly, inactivation of TLS polymerases did not abolish PCNA.Ub resistance to DNA damage, nor did PCNA.Ub cause elevated spontaneous mutagenesis, which is a defining characteristic of REV3-dependent TLS activity. Taken together, our data suggest that either the monoubiquitylation of PCNA does not promote TLS activity in all cases or PCNA.Ub reveals a currently undiscovered role for monoubiquitylated PCNA in DNA damage tolerance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».