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Enregistrement W2019631016 · doi:10.1258/ijsa.2009.009363

Diagnostic accuracy of ultrasensitive heat-denatured HIV-1 p24 antigen in non-B subtypes in Kampala, Uganda

2011· article· en· W2019631016 sur OpenAlexaff
Lisa A. Spacek, Fred Lutwama, Hasan M Shihab, James E. Summerton, Moses R. Kamya, Allan Ronald, Oliver Laeyendecker, Terrence Quinn, Harriet Mayanja‐Kizza

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of STD & AIDS · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthBill and Melinda Gates Institute for Population and Reproductive HealthBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésInterquartile rangeViral loadMedicineVirologyReverse transcriptasePolymerase chain reactionViral diseaseHuman immunodeficiency virus (HIV)Molecular biologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We evaluated the accuracy of heat-denatured, amplification-boosted ultrasensitive p24 assay (Up24) compared with reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). We tested 394 samples from Ugandans infected with HIV-1 non-B subtypes. We compared Up24 levels (HIV-1 p24 Core Profile enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), NEN Life Science Products) to RNA viral loads (Amplicor HIV-1 Monitor 1.5, Roche) by linear regression, and calculated sensitivity, specificity, positive and negative predictive values. Median viral load was 4.9 log10 copies/mL (interquartile range [IQR], 2.6-5.5); 114 samples (29%) were undetectable (<400 copies/mL). Sensitivity of the Up24 assay to detect viral load ≥400 copies/mL was 69%, specificity was 67%, and positive and negative predictive values were 84% and 47%, respectively. Sensitivity of Up24 was 90%, 80%, 68%, 62% and 45% to detect viral loads of >500,000, 250,000-500,000, 100,000-250,000, 50,000-100,000 and 400-50,000 copies/mL, respectively. In conclusion, when compared with RT-PCR for patients infected with non-B subtypes, the Up24 demonstrated limited sensitivity especially at low viral loads. Moreover, the Up24 was positive in 33% of samples deemed undetectable by RT-PCR, which may limit the use of the Up24 to detect viral suppression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,521

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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