The M603 idiotype is lost in the response to phosphocholine in terminal deoxynucleotidyl transferase-deficient mice
Notice bibliographique
Résumé
The majority of anti-phosphocholine (PC) antibodies induced by the PC epitope in Proteus morganii (PM) express the M603 idiotype (id), which is characterized by an invariant Asp to Asn substitution at the V(H):D(H) junction. To elucidate the molecular basis by which M603-like B cells acquire the mutations resulting in this invariant substitution, we analyzed the immune response to PC-PM in terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) gene knockout (KO) mice. In the absence of TdT, T15-id antibodies comprised 80-100% of the primary response to PC-PM. Less than 10% of the response in wild-type mice is T15-id(+). In TdT KO mice, the secondary response to PC-KLH was higher than in wild-type mice and was dominated by the germ-line T15-id. About 10% of this response, in both TdT KO and wild-type mice, comprised M167-id(+) antibodies. Additionally, none of the functionally rearranged V1/DFL16.1/J(H)1 cDNA isolated from PC-PM-immunized TdT KO mice showed the Asp/Asn substitution characteristic of PC-binding, PC-PM-induced M603-like antibodies. These data indicate that production of M603-id antibody is TdT dependent, while generation of M167-id antibody is TdT independent, and that in the absence of competition from M603-like B cells, T15-id B cells can respond to PC-PM.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».