Hydroperoxidase II of <i>Escherichia coli</i> Exhibits Enhanced Resistance to Proteolytic Cleavage Compared to Other Catalases
Notice bibliographique
Résumé
Catalase (hydroperoxidase) HPII of Escherichia coli is the largest catalase so far characterized, existing as a homotetramer of 84 kDa subunits. Each subunit has a core structure that closely resembles small subunit catalases, supplemented with an extended N-terminal sequence and compact flavodoxin-like C-terminal domain. Treatment of HPII with trypsin, chymotrypsin, or proteinase K, under conditions of limited digestion, resulted in cleavage of 72-74 residues from the N-terminus of each subunit that created a homotetramer of 76 kDa subunits with 80% of wild-type activity. Longer treatment with proteinase K removed the C-terminal domain, producing a transient 59 kDa subunit which was subsequently cleaved into two fragments, 26 and 32 kDa. The tetrameric structure was retained despite this fragmentation, with four intermediates being observed between the 336 kDa native form and the 236 kDa fully truncated form corresponding to tetramers with a decreasing complement of C-termini (4, 3, 2, and 1). The truncated tetramers retained 80% of wild-type activity. The T(m) for loss of activity during heating was decreased from 85 to 77 degrees C by removal of the N-terminal sequence and to 59 degrees C by removal of the C-terminal domain, revealing the importance of the C-terminal domain in enzyme stability. The sites of cleavage were determined by N- and C-terminal sequencing, and two were located on the surface of the tetramer with a third being exposed by removal of the C-terminal domain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».