MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2019897452 · doi:10.1139/g02-036

Genomic targeting and high-resolution mapping of the domestication gene<i>Q</i>in wheat

2002· article· en· W2019897452 sur OpenAlexvenueno aff
Justin D. Faris, Bikram S. Gill

Notice bibliographique

RevueGenome · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésCentimorganBiologyGeneticsLocus (genetics)Gene mappingPositional cloningGeneAmplified fragment length polymorphismGenetic linkageGene mapRestriction fragment length polymorphismYeast artificial chromosomeChromosomeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Q locus is largely responsible for the domestication of bread wheat. Q confers the free-threshing character of the spike and influences other important agronomic traits. Using chromosome deletion lines, Q was placed on the physical map within a submicroscopic segment of the long arm of chromosome 5A. We targeted markers to the segment by comparative mapping of anonymous RFLP clones, AFLP, and mRNA differential display analysis of deletion lines 5AL-7 and -23, which have deletion breakpoints that flank the Q locus. Differentially expressed sequences detected fragments at various loci on group 5 chromosomes suggesting that Q may be a regulatory gene. We identified 18 markers within the Q gene deletion interval and used them to construct a genetic linkage map of the region in F2 populations derived from chromosome 5A disomic substitution lines. The genetic map corresponding to the deletion segment was 20-cM long, and we identified markers as close as 0.7 cM to the Q gene. An estimate of base pairs per centimorgan within the region is 250 kb/cM, an 18-fold increase in recombination compared with the genomic average. Genomic targeting and high-density mapping provide a basis for the map-based cloning of the Q gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil0,091

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenomeMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207