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Enregistrement W2019981271 · doi:10.1002/ajmg.a.33021

Perspectives on<i>RUNX</i>genes: An update

2009· review· en· W2019981271 sur OpenAlexaff
M. Michael Cohen

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2009
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRUNX1Gene silencingGeneGeneticsPromoterCore binding factorTranscription factorMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This perspective on RUNX genes discusses their basic biological features, including their DNA-binding alpha subunit, their non-DNA binding beta subunit, and their Runt domain. The evolution of Runx genes begins with one most like Runx3 in invertebrates, progresses to four genes in Drosophila, and to three in vertebrates. Runx genes have two promoters and various numbers of exons and isoforms. All three genes with expressions in the same biological tissues act either synergistically or at different time periods. Runx genes have downstream target genes. Furthermore, Runx genes are mediated by TGFbeta or BMP pathways. They also have cohesin-dependent regulation. Runx1 binds the CD4 silencer and represses transcription in immature double negative thymocytes. Runx1 also activates CD8 as the double negative population progresses to double positive thymocytes. Runx3 establishes epigenetic silencing in CD4 - CD8+ cytotoxic T-cells by binding the CD4 silencer core sequence. Runx1 may also be involved in CD4 silencing in CD8+ T-cells. RUNX1 mutations cause familial thrombocytopenia with a propensity for developing acute myelogenous leukemia; two functional consequences of these mutations include haploinsufficiency and a dominant negative effect. The latter tends to be associated with a higher frequency of leukemia. RUNX2 mutations cause cleidocranial dysplasia; most are of the missense type and commonly occur in the Runt domain. RUNX3 is a tumor suppressor gene with hemizygous deletion of one allele and hypermethylation of the other, resulting in gastric adenocarcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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