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Enregistrement W2020171297 · doi:10.1074/jbc.m113.468884

The Universal Epitope of Influenza A Viral Neuraminidase Fundamentally Contributes to Enzyme Activity and Viral Replication

2013· article· en· W2020171297 sur OpenAlexafffund
Tracey M. Doyle, Bozena Jaentschke, Gary Van Domselaar, Anwar M. Hashem, Aaron Farnsworth, Nicole Forbes, Changgui Li, Junzhi Wang, Runtao He, Earl G. Brown, Xuguang Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésViral replicationNeuraminidaseBiologyAmino acidEnzymeThermostabilityInfluenza A virusMutagenesisPeptide sequenceEpitopeVirusVirologyBiochemistryMutationGeneticsGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The only universally conserved sequence among all influenza A viral neuraminidases is located between amino acids 222 and 230. However, the potential roles of these amino acids remain largely unknown. Through an array of experimental approaches including mutagenesis, reverse genetics, and growth kinetics, we found that this sequence could markedly affect viral replication. Additional experiments revealed that enzymes with mutations in this region demonstrated substantially decreased catalytic activity, substrate binding, and thermostability. Consistent with viral replication analyses and enzymatic studies, protein modeling suggests that these amino acids could either directly bind to the substrate or contribute to the formation of the active site in the enzyme. Collectively, these findings reveal the essential role of this unique region in enzyme function and viral growth, which provides the basis for evaluating the validity of this sequence as a potential target for antiviral intervention and vaccine development. Background: The influenza viral neuraminidase has only one universally conserved peptide sequence with unknown function. Results: Sequence alterations in this region decrease substrate binding, enzymatic activity, protein stability, and viral growth. Conclusion: The universal epitope is indispensable for maximal enzymatic function and robust viral propagation. Significance: The universally conserved NA sequence is an attractive target for antiviral intervention and vaccine development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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