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Enregistrement W2020345877 · doi:10.1021/jp208142k

Effects of the Distributions of Energy or Charge Transfer Rates on Spectral Hole Burning in Pigment–Protein Complexes at Low Temperatures

2011· article· en· W2020345877 sur OpenAlexaff
Nicoleta Herascu, Somaya Ahmouda, Rafael Picorel, Michael Seibert, Ryszard Jankowiak, Valter Zazubovich

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPigmentCharge (physics)Chemical physicsEnergy transferTransfer (computing)Materials scienceChemistryAtomic physicsMolecular physicsBiophysicsEnvironmental sciencePhysicsBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effects of the distributions of excitation energy transfer (EET) rates (homogeneous line widths) on the nonphotochemical (resonant) spectral hole burning (SHB) processes in photosynthetic chlorophyll-protein complexes (reaction center [RC] and CP43 antenna of Photosystem II from spinach) are considered. It is demonstrated that inclusion of such a distribution results in somewhat more dispersive hole burning kinetics. More importantly, however, inclusion of the EET rate distributions strongly affects the dependence of the hole width on the fractional hole depth. Different types of line width distributions have been explored, including those resulting from Förster type EET between weakly interacting pigments as well as Gaussian ones, which may be a reasonable approximation for those resulting, for instance, from so-called extended Förster models. For Gaussian line width distributions, it is possible to determine the parameters of both line width and tunneling parameter distributions from SHB data without a priori knowledge of any of them. Concerning more realistic asymmetric distributions, we demonstrate, using the simple example of CP43 antenna, that one can use SHB modeling to estimate electrostatic couplings between pigments and support or exclude assignment of certain pigment(s) to a particular state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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