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Enregistrement W2020386318 · doi:10.1002/chem.200902599

Ligand Close Packing, Molecular Compactness, the Methyl Tilt, Molecular Conformations, and a New Model for the Anomeric Effect

2010· article· en· W2020386318 sur OpenAlexaff
R. J. Gillespie, E. A. Robinson, Julien Pilmé

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCrystallography and molecular interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonatomic ionChemistryLone pairMoleculeLigand (biochemistry)CrystallographyAtom (system on chip)Anomeric effect

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

All the atoms in a molecule attract each other until they reach their equilibrium positions at which point the repulsive forces between the atoms just balance the attractive forces and there are no resultant forces acting on any of the atoms in the molecule. Thus, we can consider that in the equilibrium geometry the atoms in a molecule are arranged as compactly as possible. This is the basis of the ligand close packing (LCP) model according to which three or four monatomic ligands X, such as F, Cl or O (formally =O or O(-)) pack as closely as possible around a small central atom such as a boron or carbon atom giving a truly close-packed equilateral triangular AX(3) molecule or a tetrahedral AX(4) molecules. Such monatomic ligands can, to a good approximation, be described as having a spherical shape with a single ligand radius r(X). In contrast, ligands with donor atoms with lone pairs such as the oxygen atom in an OX group have a less symmetrical electron density requiring two ligand radii, r(O(lp)) in the lone pair direction, and r(O(b)) in the bonding direction, where r(O(lp)) < r(O(b)) for an approximate description. On this basis we propose an explanation for the "methyl tilt", in methanol and many related molecules, and in conjunction with the concept of compactness, a model for explaining the relative energies of the conformations of molecules containing OH and OMe ligands, including molecules that exhibit the anomeric effect. We compare our model for the anomeric effect with the widely accepted "hyperconjugation" model. We also discuss the relationship between the concept of compactness and the concept of hardness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,181
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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