The Essential Protein for Bacterial Flagella Formation FlgJ Functions as a β-N-Acetylglucosaminidase
Notice bibliographique
Résumé
The flagellum is a major virulence factor of motile pathogenic bacteria. This structure requires more than 50 proteins for its biogenesis and function, one of which is FlgJ. Homologs of FlgJ produced by the β- and γ-proteobacteria, such as Salmonella enterica, Vibrio spp., and both Sphingomonas sp. and Pseudomonas spp. are bifunctional, possessing an N-terminal domain responsible for proper rod assembly and a C-terminal domain possessing peptidoglycan lytic activity. Despite the amount of research conducted on FlgJ from these and other bacteria over the past 15 years, no biochemical analysis had been conducted on any FlgJ and consequently confusion exists as to whether the enzyme is a peptidoglycan hydrolase or a lytic transglycosylase. In this study, we present the development of a novel assay for glycoside lytic enzymes and its use to provide the first enzymatic characterization of the lytic domain of FlgJ from S. enterica as the model enzyme. Surprisingly, FlgJ functions as neither a muramidase nor a lytic transglycosylases but rather as a β-N-acetylglucosaminidase. As such, FlgJ represents the first autolysin with this activity to be characterized from a Gram-negative bacterium. At its optimal pH of 4.0, the Michaelis-Menten parameters of K(m) and k(cat) for FlgJ from S. enterica were determined to be 0.64 ± 0.18 mg ml(-1) and 0.13 ± 0.016 s(-1), respectively, using purified PG as substrate. Its catalytic residues were identified as Glu(184) and Glu(223).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».