Posttranslational Modifications in Lens Fiber Connexins Identified by Off-Line-HPLC MALDI-Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Gap junction intercellular communication is necessary for the development and maintenance of the lens. Lens fiber connexins are known to be posttranslationally modified, but little detail is available regarding the nature of some of these modifications and the specific amino acids affected. The purpose of this study was to identify posttranslational modification in the bovine lens fiber connexins, Cx44 and Cx49. METHODS: Crude preparations of bovine lens membranes were isolated by centrifugation. The membrane preparations were digested with trypsin or chymotrypsin, and the entire mixture of peptides produced was separated by reverse-phase high performance liquid chromatography and then analyzed by mass spectrometry and tandem mass spectrometry. RESULTS: Coverage of significant portions of the cytoplasmic domains of both Cx44 and Cx49 were successfully obtained. Several of the Ser and Thr residues in the C-tail of Cx44 were phosphorylated, whereas in Cx49 only Ser phosphorylation was detected; however, in this connexin, the phosphorylated residues were located in both the C-tail and the central cytoplasmic loop. The data also show that the N-terminal Met residue in each connexin is removed and that the newly exposed N termini become acetylated. In addition, cleavage sites were identified in both proteins. CONCLUSIONS: The study documented the nature and locations of several previously unknown posttranslational modifications in lens fiber connexins. This detailed knowledge of the specific posttranslationally modified sites will allow further work to elucidate the mechanisms that different signaling pathways use to regulate connexins in lens fiber cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».