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Enregistrement W2020633244 · doi:10.1167/iovs.07-1193

Posttranslational Modifications in Lens Fiber Connexins Identified by Off-Line-HPLC MALDI-Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry

2008· article· en· W2020633244 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLens FiberChemistryMass spectrometryPhosphorylationChromatographyTandem mass spectrometryBiochemistryConnexinLens (geology)Gap junctionBiologyIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Gap junction intercellular communication is necessary for the development and maintenance of the lens. Lens fiber connexins are known to be posttranslationally modified, but little detail is available regarding the nature of some of these modifications and the specific amino acids affected. The purpose of this study was to identify posttranslational modification in the bovine lens fiber connexins, Cx44 and Cx49. METHODS: Crude preparations of bovine lens membranes were isolated by centrifugation. The membrane preparations were digested with trypsin or chymotrypsin, and the entire mixture of peptides produced was separated by reverse-phase high performance liquid chromatography and then analyzed by mass spectrometry and tandem mass spectrometry. RESULTS: Coverage of significant portions of the cytoplasmic domains of both Cx44 and Cx49 were successfully obtained. Several of the Ser and Thr residues in the C-tail of Cx44 were phosphorylated, whereas in Cx49 only Ser phosphorylation was detected; however, in this connexin, the phosphorylated residues were located in both the C-tail and the central cytoplasmic loop. The data also show that the N-terminal Met residue in each connexin is removed and that the newly exposed N termini become acetylated. In addition, cleavage sites were identified in both proteins. CONCLUSIONS: The study documented the nature and locations of several previously unknown posttranslational modifications in lens fiber connexins. This detailed knowledge of the specific posttranslationally modified sites will allow further work to elucidate the mechanisms that different signaling pathways use to regulate connexins in lens fiber cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle