Characterization of virulence and PCR-DGGE profiles of <i>Fusarium avenaceum</i> from western Canadian Prairie Ecozone of Saskatchewan
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium avenaceum isolates causing fusarium head blight (FHB) in wheat were collected from the Canadian Prairies and Mixed Wood Plains Ecozones. A total of 91 isolates were grouped into 15 phenotypes and 10 VCGs which formed seven ITS rDNA phylogenetic clades and three EF-1α PCR-DGGE groups. Variation in virulence within F. avenaceum isolates ranged from high to avirulent on wheat. In general, virulent isolates demonstrated greater host range and geographic distribution, while avirulent isolates had a limited spread. Virulent isolates demonstrated greater heat tolerance, colour plasticity and growth rate compared with avirulent isolates. Overall, data indicate that pathogen dynamics and outbreaks might be influenced by the abundance ratio of virulent/avirulent isolates related to climate characteristics of each agro-region. The characterization of F. avenaceum ‘sensu lato’ isolates, obtained from western and eastern ecozones, provided baseline information on the variation that exists for this FHB-causing species. Combined with environmental or ecological information, this knowledge could establish a consistent, long-term management of the pathogen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».