Structural and expressional divergence of genes encoding <i>O</i>-methyltransferase in wheat
Notice bibliographique
Résumé
Enzymatic methylation, which is catalyzed by the large number of O-methyltransferases (OMTs), is one of the important reactions in the flow of primary and (or) secondary metabolism. In a previous study, the gene TaOMT1 was induced by Hessian fly infestation of a wheat-rye translocation line. In this study we considered other wheat OMT genes - TaOMT3, TaOMT4, and TaOMT5 - using a bioinformatics approach and examined the TaOMT genes for their genomic organization, tissue-specific expression, responses to abiotic stresses and hormones, and cis-elements. There appeared to be a homoeologous relationship between TaOMT4 (6DS) and TaOMT5 (6BS), whereas TaOMT1 and TaOMT3 were placed on chromosome arms 7BL and 5DL, respectively. Differences in the tissue-specific, constitutive, and stress-inducible expression patterns among the TaOMT genes were found in both healthy and stressed plants. A number of cis-elements, which are potentially correlated with the responses of the TaOMT genes, were detected in the analysis of the TaOMT promoter sequences. In addition, evolutionary perspectives of the TaOMT genes are discussed. The nucleotide sequences have been deposited in the GenBank database under accession Nos. AAP23942 (TaCOMT1), EF423610 (TaOMT5), EF423611 (TaOMT4), EF423612 (TaOMT3), EU831287 (5' upstream of TaOMT1), EU831288 (5' upstream of TaOMT3), EU831289 (5' upstream of TaOMT4), and EU831290 (5' upstream of TaOMT5).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».