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Enregistrement W2020716914 · doi:10.1038/ismej.2007.7

Microbial ecology and environmental biotechnology

2007· article· en· W2020716914 sur OpenAlexaboutno aff
Willy Verstraete

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobial ecologyEnvironmental biotechnologyEcologyGeomicrobiologyBiotechnologyMicrobial geneticsBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aelterman P, Rabaey K, Clauwaert P, Verstarete W . (2006). Microbial fuel cells for wastewater treatment. Water Sci Technol 54 : 9–15. Article CAS Google Scholar Boeckx P, Van Cleemput O, Villaralvo I . (1997). Methane oxidation in soils with different textures and land use. Nutr Cycl Agroecosys 49 : 91–95. Article CAS Google Scholar Boon N, De Gelder L, Lievens H, Verstraete W . (2002). Bioaugmenting bioreactors for the continuous removal of 3-chloroaniline by slow release approach. Environ Sci Technol 36 : 4698–4704. Article CAS Google Scholar Curtis TP, Sloan WT . (2004). Prokaryotic diversity and its limits: microbial community structure in nature and implications for microbial ecology. Curr Opin Microbiol 7 : 221–226. Article Google Scholar Davidson SK, Koropatnick TA, Kossmehl R, Sycuro L, McFall-Ngai MJ . (2006). NO means ‘yes’ in the squid-vibrio symbiosis: nitric oxide (NO) during the initial stages of a beneficial association. Cell Microbiol 6 : 1139–1151. Article Google Scholar Dejonghe W, Boon N, Seghers D, Top EM, Verstraete W . (2001). Bioaugmentation of soils by increasing microbial richness: missing links. Environ Microbiol 3 : 649–657. Article CAS Google Scholar Denef V, Park J, Tsoi T, Rouillard J, Zhang H, Wibbenmeyer J et al . (2004). Biphenyl and benzoate metabolism in a genomic context: outlining genome-wide metabolic networks in Burkholderia xenovorans LB400. Appl Environ Microbiol 70 : 4961–4970. Article CAS Google Scholar Dewettinck T, Van Houtte E, Geenens D, Van Hege K, Verstraete W . (2001). HACCP (Hazard Analysis and Critical Control Points) to guarantee safe water reuse and drinking water production – a case study. Wat Sci Technol 43 : 31–38. Article CAS Google Scholar Gentry TJ, Wickham GS, Schadt CW . (2006). Microarray applications in microbial ecology research. Microb Ecol 52 : 159–175. Article CAS Google Scholar Hubbell SP, Borda-De-Agua L . (2004). The unified neutral theory of biodiversity and biogeography. Ecology 85 : 3175–3178. Article Google Scholar Ishii S, Kosaka T, Hori K, Hotta Y, Watanabe K . (2005). Coaggregation facilitates interspecies hydrogen transfer between Pelotomaculum thermopropionicum and Methanothermobacter thermautotrophicus . Appl Environ Microbiol 71 : 7838–7845. Article CAS Google Scholar Ishii S, Kosaka T, Hotta Y, Watanabe K . (2006). Simulating the contribution of coaggregation to interspecies hydrogen fluxes in syntrophic methanogenic consortia. Appl Environ Microbiol 72 : 5093–5096. Article CAS Google Scholar Jorgensen BB, Gallardo VA . (1999). Thioploca spp: filamentous sulfur bacteria with nitrate vacuoles. FEMS Microbiol Ecol 28 : 301–304. Article CAS Google Scholar Lajoie CA, Sayler GS, Kelly CJ . (2002). The activated sludge biomolecular database. Water Environ Res 74 : 480–487. Article CAS Google Scholar Lovley DR . (2006). Microbial fuel cells: novel microbial physiologies and engineering approaches. Current Opin Biotechnol 17 : 327–332. Article CAS Google Scholar Maes A, Van Raemdonck H, Smith K, Ossieur W, Lebbe L, Verstraete W . (2006). Transport and activity of Desulfitobacterium dichloroeliminans strain DCA1 during biomentation of 1,2-DCA-contaminated groundwater. Environ Sci Technol 40 : 5544–5552. Article CAS Google Scholar Mertens B, Boon N, Verstraete W . (2005). Stereospecific effect of hexachlorocyclohexane on activity and structure of soil methanotrophic communities. Environ Microbiol 7 : 660–669. Article CAS Google Scholar Mohanty SR, Bodelier PLE, Floris V, Conrad R . (2006). Differential effects of nitrogenous fertilizers on methane-consuming microbes in rice field and forest soils. Appl Environ Microbiol 72 : 1346–1354. Article CAS Google Scholar Molina L, Constantinescu F, Michel L, Reimmann C, Duffy B, Defago G . (2003). Degradation of pathogen quorum-sensing molecules by soil bacteria: a preventive and curative biological control mechanism. FEMS Microbiol Ecol 45 : 71–81. Article CAS Google Scholar O’Flaherty S, Ross RP, Meaney W, Fitzgerald GF, Elbreki MF, Coffey A . (2005). Potential of the polyvalent anti- Staphylococcus bacteriophage K for control of antibiotic-resistant Staphocci from hospitals. Appl Environ Microbiol 71 : 1836–1842. Article Google Scholar Rabaey K, Verstraete W . (2005). Microbial fuel cells: novel biotechnology for energy generation. Trends Biotechnol 23 : 291–298. Article CAS Google Scholar Schimel JP, Gulledge J . (1998). Microbial community structure and global trace gases. Global Change Biol 4 : 745–758. Article Google Scholar Signor RS, Ashbolt NJ . (2006). Pathogen monitoring offers questionable protection against drinking-water risks: a QMRA (Quantitative Microbial Risk Analysis) approach to assess management strategies. Water Sci Technol 54 : 261–268. Article CAS Google Scholar Taghavi S, Barac T, Greenberg B . (2005). Horizontal gene transfer to endogenous endophytic bacteria from poplar improves phytoremediation of toluene. Appl Environ Microbiol 71 : 8500–8505. Article CAS Google Scholar Tringe SG, Von Mering C, Kobayashi A, Salamov A, Chen K, Chang HW et al . (2005). Comparative metagenomics of microbial communities. Science 308 : 554–557. Article CAS Google Scholar Vaithiyanathan S, Sheikh Q, Ku R . (2005). Effect of transinoculation of goat rumen liquor on degradation and metabolism of mimosine in sheep fed with Leucaena leucocephala leaves. Asian Austral J Anim 18 : 332–339. Article Google Scholar Van de Gast CJ, Jefferson B, Reid E . (2006). Bacterial diversity is determined by volume in membrane bioreactors. Environ Microbiol 8 : 1048–1055. Article Google Scholar Vande Woestyne M, Gellens V, Anasi I, Verstraete W . (1995). Anaerobic digestion and inter-regional recycling of organic soil supplements. In: Marchaim U, Ney G (eds). Sustainable rural environment and energy network (SREN) – Biogas technology as an environmental solution to pollution. REUR Technical Series Number 33. FAO, Rome, pp 149–169. Verthe K, Possemiers S, Boon N, Vaneechoutte M, Verstraete W . (2004). Stability and activity of an Enterobacter aerogenes -specific bacteriophage under simulated gastro-intestinal conditions. Appl Microbiol Biotechnol 65 : 465–472. Article CAS Google Scholar Watanabe K, Teramoto M, Harayama S . (2002). Stable mentation of activated sludge with foreign catabolic genes harboured by an indigenous dominant bacterium. Environ Microbiol 4 : 577–583. Article CAS Google Scholar Zhao T, Doyle MP, Zhao P . (2004). Control of listefia monocytogenes in a Biofilm by competitive-exclusion microorganisms. Appl Environ Microbiol 70 : 3996–4003. Article CAS Google Scholar Download references

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,070

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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