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Enregistrement W2020763901 · doi:10.1503/cmaj.109-3669

Standardization of genetic tests needed

2010· article· en· W2020763901 sur OpenAlexvenueno aff
William A. Glauser

Notice bibliographique

RevueCanadian Medical Association Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueTardigrade Biology and Ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDesiccationMechanism (biology)BiophysicsChemistryIntrinsically disordered proteinsDiffusionIntermolecular forceChemical physicsComputational biologyBiologyEcologyMoleculePhysicsThermodynamicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tardigrades, also known as water bears, make up a phylum of small but extremely hardy animals, renowned for their ability to survive extreme stresses, including desiccation. How tardigrades survive desiccation is one of the enduring mysteries of animal physiology. Here we show that CAHS D, an intrinsically disordered protein belonging to a unique family of proteins possessed only by tardigrades, undergoes a liquid-to-gel phase transition in a concentration dependent manner. Unlike other gelling proteins, such as gelatin, our data support a mechanism in which gel formation of CAHS D is driven by intermolecular β-β interactions. We find that gel formation corresponds with strong coordination of water and slowing of water diffusion. The degree of water coordination correlates with the ability of CAHS D to protect lactate dehydrogenase from unfolding when dried. This implies that the mechanism for unfolding protection can be attributed to a combination of hydration and slowed molecular motion. Conversely, rapid diffusion leading to efficient molecular shielding appears to be the predominant mechanism preventing protein aggregation. Our study demonstrates that distinct mechanisms are required for holistic protection during desiccation, and that protectants, such as CAHS D, can act as molecular ‘Swiss Army Knives’ capable of providing protection through several different mechanisms simultaneously.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil0,154

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0460,036

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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