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Enregistrement W2020767828 · doi:10.1128/jvi.00661-12

Human T-Cell Leukemia Virus Type 1 (HTLV-1) bZIP Factor Requires Cellular Transcription Factor JunD To Upregulate HTLV-1 Antisense Transcription from the 3′ Long Terminal Repeat

2012· article· en· W2020767828 sur OpenAlexaff
Hélène Gazon, Isabelle Lemasson, Nicholas Polakowski, Raymond Césaire, Masao Matsuoka, Benoı̂t Barbeau, Jean-Michel Mesnard, Jean‐Marie Péloponèse

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueLigue Contre le Cancer
Mots-clésBiologyTranscription factorLong terminal repeatVirologyLeukemiaHuman T-lymphotropic virus 1Transcription (linguistics)Molecular biologyVirusImmunologyGeneticsT-cell leukemiaGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infection with the human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) results in a variety of diseases including adult T-cell leukemia (ATL), a fatal malignancy characterized by the uncontrolled proliferation of virally infected CD4(+) T cells. The HTLV-1 basic leucine zipper factor (HBZ) is believed to contribute to development and maintenance of ATL. Unlike the other HTLV-1 genes, the hbz gene is encoded on the complementary strand of the provirus and therefore is not under direct control of the promoter within the 5' long terminal repeat (LTR) of the provirus. This promoter can undergo inactivating genetic or epigenetic changes during the course of ATL that eliminates expression of all viral genes except that of hbz. In contrast, repressive modifications are not known to occur on the hbz promoter located in the 3' LTR, and hbz expression has been consistently detected in all ATL patient samples. Although Sp1 regulates basal transcription from the HBZ promoter, other factors that activate transcription remain undefined. In this study, we used a proviral reporter construct deleted of the 5' LTR to show that HBZ upregulates its own expression through cooperation with JunD. Activation of antisense transcription was apparent in serum-deprived cells in which the level of JunD was elevated, and elimination of JunD expression by gene knockout or shRNA-mediated knockdown abrogated this effect. Activation through HBZ and JunD additionally required Sp1 binding at the hbz promoter. These data favor a model in which JunD is recruited to the promoter through Sp1, where it heterodimerizes with HBZ thereby enhancing its activity. Separately, hbz gene expression led to an increase in JunD abundance, and this effect correlated with emergence of features of transformed cells in immortalized fibroblasts. Overall, our results suggest that JunD represents a novel therapeutic target for the treatment of ATL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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