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Enregistrement W2020778360 · doi:10.1126/scisignal.2005020

Protein Tyrosine Phosphatase 1B Is a Regulator of the Interleukin-10–Induced Transcriptional Program in Macrophages

2014· article· en· W2020778360 sur OpenAlexafffund
Kelly A. Pike, Andrew P. Hutchins, Valérie Vinette, Jean-François Théberge, Laurent Sabbagh, Michel L. Tremblay, Diego Miranda‐Saavedra

Notice bibliographique

RevueScience Signaling · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProtein tyrosine phosphataseRegulatorPhosphataseTyrosineNegative regulatorCytokineGeneBiologyTyrosine kinaseCell biologyChemistryBiochemistryPhosphorylationImmunologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Both pro- and anti-inflammatory cytokines activate the Janus kinase (JAK)-signal transducer and activator of transcription (STAT) pathway; however, they elicit distinct transcriptional programs. Posttranslational modifications of STAT proteins, such as tyrosine phosphorylation, are critical to ensure the differential expression of STAT target genes. Although JAK-STAT signaling is dependent on reversible tyrosine phosphorylation, whether phosphatases contribute to the specificity of STAT-dependent gene expression is unclear. We examined the role of protein tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) in regulating the interleukin-10 (IL-10)-dependent, STAT3-mediated anti-inflammatory response. We found that IL-10-dependent STAT3 phosphorylation and anti-inflammatory gene expression were enhanced in macrophages from PTP1B(-/-) mice compared to those in macrophages from wild-type mice. Consistent with this finding, the IL-10-dependent suppression of lipopolysaccharide-induced macrophage activation was increased in PTP1B(-/-) macrophages compared to that in wild-type macrophages, as was the IL-10-dependent increase in the cell surface expression of the anti-inflammatory cytokine receptor IL-4Rα. Furthermore, RNA sequencing revealed the expression of genes encoding proinflammatory factors in IL-10-treated PTP1B(-/-) macrophages, which correlated with increased phosphorylation of STAT1, which is not normally highly activated in response to IL-10. These findings identify PTP1B as a central regulator of IL-10R-STAT3 and IL-10R-STAT1 signaling, and demonstrate that phosphatases can tailor the quantitative and qualitative properties of cytokine-induced transcriptional responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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