Occurrence of β-Lactamase Genes Among Non-Typhi <i>Salmonella enterica</i> Isolated from Humans, Food Animals, and Retail Meats in the United States and Canada
Notice bibliographique
Résumé
Non-Typhi Salmonella cause over 1.7 million cases of gastroenteritis in North America each year, and food-animal products are commonly implicated in human infections. For invasive infections, antimicrobial therapy is indicated. In North America, the antimicrobial susceptibility of Salmonella is monitored by the U.S. National Antimicrobial Resistance Monitoring System (NARMS) and The Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS). In this study, we determined the susceptibility to cephalosporins by broth microdilution among 5,041 non-Typhi Salmonella enterica isolated from food animals, retail meats, and humans. In the United States, 109 (4.6%) of isolates collected from humans, 77 (15.7%) from retail meat, and 140 (10.6%) from food animals displayed decreased susceptibility to cephalosporins (DSC). Among the Canadian retail meat and food animal isolates, 52 (13.0%) and 42 (9.4%) displayed DSC. All isolates displaying DSC were screened for β-lactamase genes (bla(TEM), bla(SHV), bla(CMY), bla(CTX-M), and bla(OXA-1)) by polymerase chain reaction. At least one β-lactamase gene was detected in 74/109 (67.9%) isolates collected from humans, and the bla(CMY) genes were most prevalent (69/109; 63.3%). Similarly, the bla(CMY) genes predominated among the β-lactamase-producing isolates collected from retail meats and food animals. Three isolates from humans harbored a bla(CTX-M-15) gene. No animal or retail meat isolates harbored a bla(CTX-M) or bla(OXA-1) gene. A bla(TEM) gene was found in 5 human, 9 retail meat, and 17 animal isolates. Although serotype distributions varied among human, retail meat, and animal sources, overlap in bla(CMY)-positive serotypes across sample sources supports meat and food-animal sources as reservoirs for human infection.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».