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Enregistrement W2020925800 · doi:10.1255/ejms.673

Characterization of the <i>O</i> -4 Phosphorylated and <i>O</i> -5 Substituted Kdo Reducing End Group and Sequencing of the Core Oligosaccharide of <i>Aeromonas Salmonicida</i> ssp <i>Salmonicida</i> Lipopolysaccharide Using Tandem Mass Spectrometry

2004· article· en· W2020925800 sur OpenAlex
Joseph Banoub, Anas El Aneed, Alejandro Cohen, Patrick Martin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Mass Spectrometry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAeromonas salmonicidaChemistryOligosaccharideTandem mass spectrometryElectrospray ionizationMass spectrometryChromatographyStereochemistryBiochemistryBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular structure of the wild strain of the lipopolysaccharide core of Aeromonas salmonicida, ssp salmonicida has been sequenced using tandem mass spectrometry. The core oligosaccharide was determined to contain an O-4 phosphorylated and O-5 substituted Kdo reducing group, and its structure is proposed as the follows: [structure: see text] After the core oligosaccharide of LPS was released from the lipid A portion by conventional treatment with 1% acetic acid, we demonstrated the existence of a homogeneous mixture composed mainly of the native core oligosaccharide containing the Kdo with its O-4 phosphate group intact, and a degraded core oligosaccharide mixture, which eliminated the O-4 phosphate group with extreme facility. The precise molecular structure and glycone sequence of the homogeneous mixture of phosphorylated and dephosphorylated core oligosaccharides was determined by electrospray ionization (ESI) mass spectrometry and tandem mass spectrometric analysis. CID-MS/MS of the homogeneous mixture of permethylated core oligosaccharides afforded a series of diagnostic product ions which confirmed the established sequence of the glycones to be determined. Matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) tandem mass spectrometry reconfirmed the molecular structure of the dephosphorylated homogeneous permethylated mixture of the core oligosaccharides containing the diastereomeric 4,8- and 4,7-anhydro-alpha-keto acids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,876

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle