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Enregistrement W2021269933 · doi:10.1021/jm0111043

Identification of Nonpeptidic Urotensin II Receptor Antagonists by Virtual Screening Based on a Pharmacophore Model Derived from Structure−Activity Relationships and Nuclear Magnetic Resonance Studies on Urotensin II

2002· article· en· W2021269933 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular, Neuropeptides, and Oxidative Stress Research
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPharmacophoreUrotensin-IIChemistryIdentification (biology)Virtual screeningComputational biologyPharmacologyReceptorStereochemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vasoactive cyclic 11-amino acid peptide urotensin II (U-II) has recently been discovered as the endogenous ligand of the orphan G-protein-coupled receptor GPR14. As U-II might be involved in the regulation of cardiovascular homeostasis and pathology, a nonpeptidic GPR14/U-II antagonist is of considerable basic and therapeutic interest. We have performed structure-activity relationship studies on U-II by investigating 25 peptide analogues to mobilize intracellular calcium in GPR14-transfected CHO cells, demonstrating that only the side chains of the residues Trp-7, Lys-8, and Tyr-9 are required for receptor recognition and activation. The solution structure of U-II derived by nuclear magnetic resonance has served as a structural template for a three-dimensional three point pharmacophore query for the virtual screening of the Aventis compound repository for nonpeptidic U-II receptor antagonists. Highly active lead compounds of six different scaffold classes could be identified, antagonizing the biological activity of U-II in vitro. The most potent compound identified by the virtual screening approach, 1-(3-carbamimidoyl-benzyl)-4-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid (naphthalen-1-ylmethyl)amide, reveals an IC(50) of 400 nM in a functional fluorometric imaging plate reader assay and constitutes a promising lead.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil0,889

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle