Microbial diversity and activity through a permafrost/ground ice core profile from the Canadian high Arctic
Notice bibliographique
Résumé
Culture-dependent and culture-independent methods were used in an investigation of the microbial diversity in a permafrost/massive ground ice core from the Canadian high Arctic. Denaturing gradient gel electrophoresis as well as Bacteria and Archaea 16S rRNA gene clone libraries showed differences in the composition of the microbial communities in the distinct core horizons. Microbial diversity was similar in the active layer (surface) soil, permafrost table and permafrost horizons while the ground ice microbial community showed low diversity. Bacteria and Archaea sequences related to the Actinobacteria (54%) and Crenarchaeota (100%) respectively were predominant in the active layer while the majority of sequences in the permafrost were related to the Proteobacteria (57%) and Euryarchaeota (76%). The most abundant phyla in the ground ice clone libraries were the Firmicutes (59%) and Crenarchaeota (82%). Isolates from the permafrost were both less abundant and diverse than in the active layer soil, while no culturable cells were recovered from the ground ice. Mineralization of [1-(14)C] acetic acid and [2-(14)C] glucose was used to detect microbial activity in the different horizons in the core. Mineralization was detected at near ambient permafrost temperatures (-15 degrees C), indicating that permafrost may harbour an active microbial population, while the low microbial diversity, abundance and activity in ground ice suggests a less hospitable microbial habitat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».