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Enregistrement W2021327342 · doi:10.1111/j.1462-2920.2008.01746.x

Microbial diversity and activity through a permafrost/ground ice core profile from the Canadian high Arctic

2008· article· en· W2021327342 sur OpenAlexafffundabout
Blaire Steven, Wayne H. Pollard, Charles W. Greer, Lyle G. Whyte

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueClimate change and permafrost
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Space AgencyAmes Research CenterNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésPermafrostCrenarchaeotaBiologyArchaeaTemperature gradient gel electrophoresisLibraryEuryarchaeotaEcologyArcticMicrobial population biologyFirmicutesAcidobacteriaActinobacteriaBacteria16S ribosomal RNAPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Culture-dependent and culture-independent methods were used in an investigation of the microbial diversity in a permafrost/massive ground ice core from the Canadian high Arctic. Denaturing gradient gel electrophoresis as well as Bacteria and Archaea 16S rRNA gene clone libraries showed differences in the composition of the microbial communities in the distinct core horizons. Microbial diversity was similar in the active layer (surface) soil, permafrost table and permafrost horizons while the ground ice microbial community showed low diversity. Bacteria and Archaea sequences related to the Actinobacteria (54%) and Crenarchaeota (100%) respectively were predominant in the active layer while the majority of sequences in the permafrost were related to the Proteobacteria (57%) and Euryarchaeota (76%). The most abundant phyla in the ground ice clone libraries were the Firmicutes (59%) and Crenarchaeota (82%). Isolates from the permafrost were both less abundant and diverse than in the active layer soil, while no culturable cells were recovered from the ground ice. Mineralization of [1-(14)C] acetic acid and [2-(14)C] glucose was used to detect microbial activity in the different horizons in the core. Mineralization was detected at near ambient permafrost temperatures (-15 degrees C), indicating that permafrost may harbour an active microbial population, while the low microbial diversity, abundance and activity in ground ice suggests a less hospitable microbial habitat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,156 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations173
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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