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Enregistrement W2021383713 · doi:10.1021/np2001573

Isolation, Structure, and Biological Activities of Fellutamides C and D from an Undescribed <i>Metulocladosporiella</i> (Chaetothyriales) Using the Genome-Wide <i>Candida albicans</i> Fitness Test

2011· article· en· W2021383713 sur OpenAlexaff
Deming Xu, John G. Ondeyka, Guy H. Harris, Deborah L. Zink, Jennifer Nielsen Kahn, Hao Wang, Gerald F. Bills, Gonzalo Platas, Wenxian Wang, Alexander A. Szewczak, Paul Liberator, Terry Roemer, Sheo B. Singh

Notice bibliographique

RevueJournal of Natural Products · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCandida albicansIsolation (microbiology)BiologyGenomeMicrobiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a whole-cell mechanism of action (MOA)-based screening strategy for discovery of antifungal agents, Candida albicans was used, followed by testing of active extracts in the C. albicans fitness test (CaFT), which provides insight into the mechanism of action. A fermentation extract of an undescribed species of Metulocladosporiella that inhibited proteasome activity in a C. albicans fitness test was identified. The chemical genomic profile of the extract contained hypersensitivity of heterozygous deletion strains (strains that had one of the genes of the diploid genes knocked down) of genes represented by multiple subunits of the 25S proteasome. Two structurally related peptide aldehydes, named fellutamides C and D, were isolated from the extract. Fellutamides were active against C. albicans and Aspergillus fumigatus with MICs ranging from 4 to 16 μg/mL and against fungal proteasome (IC₅₀ 0.2 μg/mL). Both compounds showed proteasome activity against human tumor cell lines, potently inhibiting the growth of PC-3 prostate carcinoma cells, but not A549 lung carcinoma cells. In PC-3 cells compound treatment produced a G2M cell cycle block and induced apoptosis. Preliminary SAR studies indicated that the aldehyde group is critical for the antifungal activity and that the two hydroxy groups are quantitatively important for potency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,420
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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