Plug−Plug Kinetic Capillary Electrophoresis: Method for Direct Determination of Rate Constants of Complex Formation and Dissociation
Notice bibliographique
Résumé
We present a method for direct determination of rate constants of complex formation, k(on), and dissociation, k(off). The method is termed plug-plug kinetic capillary electrophoresis (ppKCE). To explain the concept of the method, we consider the formation of a noncovalent complex C between molecules A and B; A is assumed to migrate slower in electrophoresis than B. In ppKCE, a short plug of A is injected into a capillary, followed by a short plug of B. When a high voltage is applied, the electrophoretic zone of B moves through that of A, allowing for the formation of C. When the zones of A and B are separated, C starts dissociating. The features of the resulting electropherogram are defined by both binding and dissociation. We developed a unique mathematical approach that allows finding k(on) and k(off) from a single electropherogram without nonlinear regression analysis. The approach uses algebraic functions with the only input parameters from electropherograms being areas and migration times of electrophoretic peaks. In this work, we explain theoretical bases of ppKCE and prove the principle of the method by finding k(on) and k(off) for a protein-ligand complex. The unique capability of the method to directly determine both k(on) and k(off) along with its simplicity make ppKCE highly attractive to a broad community of molecular scientists.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».