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Enregistrement W2021600858 · doi:10.2136/sssaj2007.0045

Comparison of Solid‐State Carbon‐13 Nuclear Magnetic Resonance and Organic Matter Biomarkers for Assessing Soil Organic Matter Degradation

2008· article· en· W2021600858 sur OpenAlexaffabout
Myrna J. Simpson, Angelika Otto, Xiaojuan Feng

Notice bibliographique

RevueSoil Science Society of America Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePesticide and Herbicide Environmental Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCutinChemistryOrganic matterSoil organic matterSuberinLigninEnvironmental chemistryBiomarkerDegradation (telecommunications)Soil waterOrganic chemistryBiochemistryGeologySoil science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soil organic matter (SOM) is a heterogeneous mixture of compounds that are derived from a number of sources. Therefore, trying to assess the stage of SOM alteration is challenging. Recently, our research has proposed a number of degradation parameters based on the measurement of SOM biomarkers. These biomarkers, which can be attributed to a specific organism source and the stage of alteration (oxidation) of a compound can provide information regarding the stage and rate of SOM degradation. The previously developed biomarker ratios for assessing SOM degradation have not been tested with degradation parameters derived from other molecular methods. This study investigates the use of solid‐state 13 C nuclear magnetic resonance (NMR) and organic matter biomarker methods for the assessment of SOM degradation in four soils from Western Canada. Total solvent extraction was used to isolate free lipids, base hydrolysis was used to extract bound lipids, and copper (II) oxide (CuO) oxidation was used to liberate lignin monomers and dimers from the soil. The presence of plant sterols and their oxidative degradation products facilitated the analysis of SOM alteration. Cutin and suberin degradation parameters were applied to study the relative amounts of suberin versus cutin inputs into soil as well as the stage of cutin and suberin degradation. The extent of oxidation for lignin‐derived compounds was also tabulated. The trends observed by solid‐state 13 C NMR (alkyl/O‐alkyl ratios) were consistent with those found with the biomarker techniques, however, it should be noted that the biomarker methods provide detailed information on specific compounds whereas solid‐state 13 C NMR only provides information on the “bulk” structure of SOM. Because only a small portion of SOM components are amenable to analysis by biomarker methods, it is advantageous to use these methods in tandem with solid‐state 13 C NMR spectroscopy and other molecular techniques when investigating SOM sources and biogeochemistry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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