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Enregistrement W2021642907 · doi:10.1093/nar/gks764

Ablation of PRMT6 reveals a role as a negative transcriptional regulator of the p53 tumor suppressor

2012· article· en· W2021642907 sur OpenAlexafffund
Mathieu Neault, Frédérick A. Mallette, Gillian Vogel, Jonathan Michaud‐Levesque, Stéphane Richard

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Foundation
Mots-clésBiologySenescenceTranscriptional regulationRegulatorCell biologyRepressorHistoneMethylationChromatin immunoprecipitationChromatinRegulation of gene expressionMolecular biologyGene expressionGeneGeneticsPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arginine methylation of histones is a well-known regulator of gene expression. Protein arginine methyltransferase 6 (PRMT6) has been shown to function as a transcriptional repressor by methylating the histone H3 arginine 2 [H3R2(me2a)] repressive mark; however, few targets are known. To define the physiological role of PRMT6 and to identify its targets, we generated PRMT6(-/-) mouse embryo fibroblasts (MEFs). We observed that early passage PRMT6(-/-) MEFs had growth defects and exhibited the hallmarks of cellular senescence. PRMT6(-/-) MEFs displayed high transcriptional levels of p53 and its targets, p21 and PML. Generation of PRMT6(-/-); p53(-/-) MEFs prevented the premature senescence, suggesting that the induction of senescence is p53-dependent. Using chromatin immunoprecipitation assays, we observed an enrichment of PRMT6 and H3R2(me2a) within the upstream region of Trp53. The PRMT6 association and the H3R2(me2a) mark were lost in PRMT6(-/-) MEFs and an increase in the H3K4(me3) activator mark was observed. Our findings define a new regulator of p53 transcriptional regulation and define a role for PRMT6 and arginine methylation in cellular senescence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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