Spoligotype analysis of<i>Mycobacterium bovis</i>isolates from Northern México
Notice bibliographique
Résumé
Bovine tuberculosis is still rife in Latin America, producing huge economic losses. There are very few studies of the way this disease is spread through this geographical region, particularly in countries that border those that are almost free of Mycobacterium bovis. In this work, we have analyzed the spacer oligonucleotide typing (spoligotype) patterns of M. bovis isolates from cattle at Ciudad Juárez, a Mexican city close to El Paso, Texas. Fifty-eight M. bovis isolates collected from a herd in Northern Mexico were studied by spoligotyping. Nine spoligotype patterns were observed in total. Two were predominant (SB0121 and SB0140) and accounted for 50% and 14% of the isolates, respectively. Six patterns were found to be already described in an international M. bovis spoligotype database, while the other three (SB0985, SB0986, and SB0987) were novel. Interestingly, none of the isolates corresponded to any other Mexican pattern previously reported. This is the first spoligotype analysis of M. bovis strains from a border city between Mexico and the United States. The necessity for further studies to formulate a better identification of M. bovis strains within, and its dissemination between, the two countries is discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».