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Enregistrement W2021759821 · doi:10.1107/s0909049511056305

<i>MxDC</i>and<i>MxLIVE</i>: software for data acquisition, information management and remote access to macromolecular crystallography beamlines

2012· article· en· W2021759821 sur OpenAlexafffundabout
Michel Fodje, Kathryn Janzen, Russ Berg, Gillian Black, Shaunivan Labiuk, James Gorin, Paweł Grochulski

Notice bibliographique

RevueJournal of Synchrotron Radiation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWestern Economic Diversification CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of SaskatchewanCanadian Light Source
Mots-clésBeamlineSoftwareData acquisitionInterface (matter)Computer scienceGraphical user interfaceData managementData collectionUser interfaceWeb browserSample (material)Operating systemDatabaseThe InternetOpticsChemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An integrated computer software system for on-site and remote collection of macromolecular crystallography (MX) data at the Canadian Light Source (CLS) is described. The system consists of an integrated graphical user interface for data collection and beamline control [MX Data Collector (MxDC)] which provides experiment-focused control of beamline devices, and a laboratory information management system [MX Laboratory Information Virtual Environment (MxLIVE)] for managing sample and experiment information through a web browser. The system allows remote planning and transmission of sample and experiment parameters to the beamline through MxLIVE, on-site or remote data collection through MxDC guided by information from MxLIVE, and remote monitoring and download of experimental results through MxLIVE. The system is deployed and in use on both MX beamlines at the CLS which constitute the Canadian Macromolecular Crystallography Facility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,338

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1010,051

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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