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Enregistrement W2021839708 · doi:10.1118/1.3182294

MO‐FF‐A3‐06: Preliminary Feasibility Study: Modeling 3D Deformations of the Prostate From Whole‐Mount Histology to in Vivo MRI

2009· article· en· W2021839708 sur OpenAlexaff
Andrea McNiven, Joanne Moseley, DL Langer, MA Haider, K. Brock

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMedical Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn vivoProstateMagnetic resonance imagingEx vivoHistologyProstatectomyContouringImage registrationFixation (population genetics)Biomedical engineeringNuclear medicineMedicineComputer sciencePathologyRadiologyArtificial intelligenceBiologyCancerImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose : To investigate the accuracy of a 3D biomechanical model‐based deformation algorithm (MORFEUS) in modeling the prostate deformation that occurs between in vivo magnetic resonance imaging (MRI) and identification of the tumor on whole‐mount histology. Method and Materials : Three image sets were acquired for 10 patients: 1) in vivo T2‐weighted MR images acquired prior to prostatectomy, 2) ex vivo T2‐weighted MR images, and 3) digital images of the histological slices, rigidly registered to construct a 3D volumetric image. All three images sets were imported into the radiation treatment planning system for contouring. The entire prostate gland, the peripheral zone and central gland were contoured. The prostate was converted into a finite element model, where each zone was assigned the appropriate material property. Naturally occurring structural and morphological features ( e.g. urethra) were identified as verification points in the in vivo, ex vivo , and histological images, for quantification of the accuracy of the deformable registration. MORFEUS was used to model the deformations that occur due to excision and fixation either directly, deforming histology to in vivo MRI, or using a two‐step process, histology to in vivo MRI via an intermediate step, using ex vivo MRI. Results : Initial analysis has been completed for a subset of the patients. Uncertainties following rigid registration alone exceeded 8.0mm. No significant improvements were observed when including the intermediate deformation step. The average absolute error following deformable registration, based on the verification points, was 1.3, 1.2, and 1.9mm in the left/right, anterior/posterior, and superior/inferior directions, respectively. This error is smaller than the 3 mm image slice thickness. Conclusions : Substantial deformation confounds the ability to compare histology with in vivo imaging. Deformable registration using MORFEUS can be used to resolve the deformation, enabling quantitative evaluation of in vivo imaging based on histology as a gold standard for tumor definition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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