MO‐FF‐A3‐06: Preliminary Feasibility Study: Modeling 3D Deformations of the Prostate From Whole‐Mount Histology to in Vivo MRI
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: To investigate the accuracy of a 3D biomechanical model‐based deformation algorithm (MORFEUS) in modeling the prostate deformation that occurs between in vivo magnetic resonance imaging (MRI) and identification of the tumor on whole‐mount histology. Method and Materials: Three image sets were acquired for 10 patients: 1) in vivo T2‐weighted MR images acquired prior to prostatectomy, 2) ex vivo T2‐weighted MR images, and 3) digital images of the histological slices, rigidly registered to construct a 3D volumetric image. All three images sets were imported into the radiation treatment planning system for contouring. The entire prostate gland, the peripheral zone and central gland were contoured. The prostate was converted into a finite element model, where each zone was assigned the appropriate material property. Naturally occurring structural and morphological features (e.g. urethra) were identified as verification points in the in vivo, ex vivo, and histological images, for quantification of the accuracy of the deformable registration. MORFEUS was used to model the deformations that occur due to excision and fixation either directly, deforming histology to in vivo MRI, or using a two‐step process, histology to in vivo MRI via an intermediate step, using ex vivo MRI. Results: Initial analysis has been completed for a subset of the patients. Uncertainties following rigid registration alone exceeded 8.0mm. No significant improvements were observed when including the intermediate deformation step. The average absolute error following deformable registration, based on the verification points, was 1.3, 1.2, and 1.9mm in the left/right, anterior/posterior, and superior/inferior directions, respectively. This error is smaller than the 3 mm image slice thickness. Conclusions: Substantial deformation confounds the ability to compare histology with in vivo imaging. Deformable registration using MORFEUS can be used to resolve the deformation, enabling quantitative evaluation of in vivo imaging based on histology as a gold standard for tumor definition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».