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Enregistrement W2021844080 · doi:10.1002/mbo3.173

Comparison of cyanobacterial microcystin synthetase (<i>mcy</i>) <i>E</i> gene transcript levels, <i>mcy E</i> gene copies, and biomass as indicators of microcystin risk under laboratory and field conditions

2014· article· en· W2021844080 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueMicrobiologyOpen · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesMax Bell Foundation
Mots-clésMicrocystinCyanobacteriaMicrocystisMicrocystis aeruginosaBiologyCyanotoxinGeneGene expressionMicrobiologyMicrocystin-LRGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increased incidences of mixed assemblages of microcystin-producing and nonproducing cyanobacterial strains in freshwater bodies necessitate development of reliable proxies for cyanotoxin risk assessment. Detection of microcystin biosynthetic genes in water blooms of cyanobacteria is generally indicative of the presence of potentially toxic cyanobacterial strains. Although much effort has been devoted toward elucidating the microcystin biosynthesis mechanisms in many cyanobacteria genera, little is known about the impacts of co-occurring cyanobacteria on cellular growth, mcy gene expression, or mcy gene copy distribution. The present study utilized conventional microscopy, qPCR assays, and enzyme-linked immunosorbent assay to study how competition between microcystin-producing Microcystis aeruginosa CPCC 299 and Planktothrix agardhii NIVA-CYA 126 impacts mcyE gene expression, mcyE gene copies, and microcystin concentration under controlled laboratory conditions. Furthermore, analyses of environmental water samples from the Missisquoi Bay, Quebec, enabled us to determine how the various potential toxigenic cyanobacterial biomass proxies correlated with cellular microcystin concentrations in a freshwater lake. Results from our laboratory study indicated significant downregulation of mcyE gene expression in mixed cultures of M. aeruginosa plus P. agardhii on most sampling days in agreement with depressed growth recorded in the mixed cultures, suggesting that interaction between the two species probably resulted in suppressed growth and mcyE gene expression in the mixed cultures. Furthermore, although mcyE gene copies and McyE transcripts were detected in all laboratory and field samples with measureable microcystin levels, only mcyE gene copies showed significant positive correlations (R(2) > 0.7) with microcystin concentrations, while McyE transcript levels did not. These results suggest that mcyE gene copies are better indicators of potential risks from microcystins than McyE transcript levels or conventional biomass proxies, especially in water bodies comprising mixed assemblages of toxic and nontoxic cyanobacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle