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Enregistrement W2021864751 · doi:10.1182/blood-2013-01-479865

Analysis of FOXO1 mutations in diffuse large B-cell lymphoma

2013· article· en· W2021864751 sur OpenAlexafffund
Diane L. Trinh, David W. Scott, Ryan D. Morin, María Méndez-Lago, Jianghong An, Steven J.M. Jones, Andrew J. Mungall, Yongjun Zhao, Jacqueline E. Schein, Christian Steidl, Joseph M. Connors, Randy D. Gascoyne, Marco A. Marra

Notice bibliographique

RevueBlood · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Cancer AgencyCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFOXO1Diffuse large B-cell lymphomaCancer researchMutationLymphomaBiologyGeneticsOncologyMedicineInternal medicineGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) accounts for 30% to 40% of newly diagnosed lymphomas and has an overall cure rate of approximately 60%. Previously, we observed FOXO1 mutations in non-Hodgkin lymphoma patient samples. To explore the effects of FOXO1 mutations, we assessed FOXO1 status in 279 DLBCL patient samples and 22 DLBCL-derived cell lines. FOXO1 mutations were found in 8.6% (24/279) of DLBCL cases: 92.3% (24/26) of mutations were in the first exon, 46.2% (12/26) were recurrent mutations affecting the N-terminal region, and another 38.5% (10/26) affected the Forkhead DNA binding domain. Recurrent mutations in the N-terminal region resulted in diminished T24 phosphorylation, loss of interaction with 14-3-3, and nuclear retention. FOXO1 mutation was associated with decreased overall survival in patients treated with rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone (P = .037), independent of cell of origin (COO) and the revised International Prognostic Index (R-IPI). This association was particularly evident (P = .003) in patients in the low-risk R-IPI categories. The independent relationship of mutations in FOXO1 to survival, transcending the prognostic influence of the R-IPI and COO, indicates that FOXO1 mutation is a novel prognostic factor that plays an important role in DLBCL pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations157
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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