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Enregistrement W2021870644 · doi:10.1128/jb.01681-08

Quorum Quenching in <i>Agrobacterium tumefaciens</i> : Chance or Necessity?

2008· letter· en· W2021870644 sur OpenAlexaff
Catharine E. White, Turlough M. Finan

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2008
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAgrobacterium tumefaciensQuorum QuenchingAgrobacteriumQuorum sensingMicrobiologyQuenching (fluorescence)GeneticsBacteriaTransformation (genetics)GeneBiofilm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell-cell communication or “quorum sensing” (QS) between members of a population is an established phenomenon that has been described for many different bacterial species. A number of different types of QS systems have been discovered; however, a unifying theme is the synthesis of a small signal molecule, often called an autoinducer or pheromone, which activates a specific response when it accumulates to a threshold concentration within a population. A relatively new and exciting aspect of the field of QS that has received much recent attention is “quorum quenching” (QQ), or interference of a QS signaling system. This occurs through either the inhibition of a QS component or the depletion of the signal itself, resulting in an attenuation of the response. In the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens, an enzyme (BlcC) that destroys the bacterium's QS signal has been recently described, prompting much speculation that this enzyme is specifically involved in the quenching of the QS system. A variety of explanations for the adaptive significance of QQ in the QS system of A. tumefaciens and implications for the bacterium's role as a plant pathogen have been suggested in the literature (for example, see references 4 and 27). However, the role of BlcC in QQ was never directly addressed. In A. tumefaciens, the QS system regulates Ti (tumor-inducing) plasmid conjugation. In this issue, Khan and Farrand (12) directly address the biological significance of BlcC by examining its effect on Ti plasmid conjugation both in culture and in planta. Their study has implications for our understanding of the possible roles in Agrobacterium and other bacteria of BlcC-like enzymes, which are generally thought to function as quorum quenchers of proteobacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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