Identification of Proteins with Increased Expression in Rheumatoid Arthritis Synovial Tissues
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: A proteomic approach was applied to discover novel rheumatoid arthritis (RA)-specific proteins by comparing the expression profiles of synovial membranes from patients with RA, osteoarthritis (OA), and ankylosing spondylitis (AS). METHODS: Synovial tissues were collected from patients with RA (n = 10), OA (n = 10), or AS (n = 6), and healthy controls matched for age and sex. Proteins were separated by 2-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, and the proteins with significantly increased expression in the RA samples were subject to matrix-assisted laser adsorption-ionization time-of-flight spectrometry. Results were verified using Western blot and immunohistochemistry. Levels of the candidate proteins were measured within plasma and synovial fluids from the RA patients (n = 30), who had disease duration of 3-7 years, using ELISA. Levels were also measured within plasma from unmedicated RA patients (n = 41), who had disease duration of 1-6 months. RESULTS: Compared with the OA and AS tissue samples, the proteins Ig-kappa light-chain C region, PRDX4, SOD2, TPI, and TXNDC5 were found with increased expression in synovial tissues of RA patients. PRDX4, SOD2, TPI, and TXNDC5 had 2-fold or more increase in expression in some of the early RA plasma samples (58.55%, 31.7%, 26.8%, and 36.6%, respectively) as compared with the early OA samples and control samples. TXNDC5 had 2-fold or more increase in expression in 53.3% of blood samples and 73.3% of synovial fluid samples from patients with long disease duration of RA as compared with samples from OA and AS patients. CONCLUSION: Functional classification indicated that these identified proteins were related with cell differentiation, glycol metabolism, immunoactivation, and endogenous antioxidant reaction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».